1、特点不同：水果玉米植株较矮，分蘖力较强，果穗苞叶上有旗叶。子粒淡黄或白色，胚较大，乳熟期子实柔嫩、富含水溶性多糖、维生素A、维生素C、脂肪和蛋白质等。普通玉米栽培技术简单，具有较高的经济价值、营养价值和加工价值。
2、两者的起源不同：水果玉米起源于前哥伦比亚时期的中美洲和南美洲，中国是普通糯玉米的世界起源中心，栽培历史悠久。
3、两者的分类不同：水果玉米从含糖量上分为普通型水果玉米、超甜型水果玉米、加强甜水果玉米。超甜玉米是可以直接生食的品种。从颜色上分为：黄色、白色、双色（黄白相间）、和纯白色四种。普通玉米按照颜色可以分为白色糯玉米、黄色糯玉米、黑色糯玉米（俗称黑珍珠）、彩色糯玉米（花糯）。
玉米是什么植物
玉蜀黍（学名：Zea mays L.）是禾本科、玉蜀黍属植物，俗称玉米。 一年生高大草本。秆直立，通常不分枝，高1-4米。叶鞘具横脉；叶舌膜质，长约2毫米；叶片扁平宽大。顶生雄性圆锥花序大型，雄性小穗孪生，长达1厘米。颖果球形或扁球形，一般长5-10毫米。花果期秋季。
原产于中美洲和南美洲。全世界热带和温带地区广泛种植。玉蜀黍的营养价值较高，是优良的粮食作物；也是食品、医疗卫生、轻工业、化工业等的不可或缺的原料之一。2018年8月，财政部、农业农村部、银保监会印发通知，将玉蜀黍作物制种纳入中央财政农业保险保险费补贴目录。
玉米的起源
用生物进化观点来探讨玉蜀黍的近缘祖先及其演变为现代玉蜀黍的过程。栽培玉蜀黍的野生祖先是一种类玉蜀黍。
玉蜀黍族（Maydae）内的植物共有7个属，其中玉蜀黍属（zea）和摩擦禾属（Tripsacum）原产美洲。与玉蜀黍有关是类玉蜀黍（Teosinte），俗称大刍草，分类上原为类蜀黍属（Euchlaena），已改为Zea mexicana。它包括6个一年生的野生种家族，分布于墨西哥、危地马拉、洪都拉斯的广大地域内，与玉蜀黍有很低的亲缘关系，在植株外形和花序器官等方面与玉蜀黍也有相似之处。
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